selex 원리 selex

Selex란

nucleic acid 로 이루어진 ligand 를 여러 단계의 affinity purification 을 통해 얻어내는 것인데 nucleic acid 이기 때문에 각 단계 사이사이에 증폭을 할 수 있습니다.

예를 들어 X 라는 단백질이 DNA binding protein 인데 여기에 binding 하는 sequence 가 TA 라고 합시다. 이것을 찾아내기 위해서는 일단 degenerate oligonucleotide pool 을 만듭니다. NN 으로 합성하면 여기에는 AA,AC,AG,AT,.....TT 까지 64 가지가 섞여 있겠지요. 이것을 X 로 IP 하면 TA 가 나오겠지만 non specific 도 있을 것 입니다. IP product 를 PCR 을 해서 다시 증폭시킨 후 IP 를 해 주는 과정을 반복해주면 specific binding 은 지수적으로 증폭되고 nonspecific bindnig 은 감소되어 갑니다. 적당한 횟수 만큼 반복한 후 Tvector 에 ligation 시켜서 sequencing 을 해 보면 X 단백질에 affinity 가 높은 DNA sequence 들을 얻을 수 있을 것 입니다.